Lorsqu'un habitat est jugé contaminé par des moisissures, des mesures d'assainissement adaptées doivent être prises selon l'importance de la contamination mais, également selon le type et la gravité des symptômes des habitants. Sur le plan fongique, les méthodes d'assainissement devront tenir compte de 3 problématiques de risques fondamentalement différentes :
- Risque d'allergie chez les individus allergiques exposés à de trop grandes quantités de spores
- Risque d'intoxications diverses en présence de trop grandes quantités de mycotoxines et de MVOC
- Risque de mycoses invasives pour les individus dont l'immunité est amoindrie.
Ces trois classes de risques exigent des méthodes d'assainissement spécifiques de l'habitat correspondantes